Spack¶
初次安装¶
- 添加 shell 支持
- 如果集群上已经下载过 Spack，加载脚本一般在
spack/share/spack/setup-env.sh
- 如果集群上已经下载过 Spack，加载脚本一般在
- 配置编译器
spack compilerlistadd=findinfospack config edit compilers可以进一步指定编译选项、设置环境变量。- spack 常常是不能自动检测到 gfortran 的，之后安装 OpenMPI 会报缺少 Fortran 编译器，记得配置一下。
- 添加系统已有的包：
spack config edit packages，以 CUDA 为例：
packages:
all:
variants: +cuda cuda_arch=80
cuda:
externals:
- spec: "cuda@12.3%gcc@12.2.0 arch=linux-debian12-x86_64"
prefix: /usr/local/cuda-12.3
extra_attributes:
environment:
prepend_path:
LD_LIBRAY_PATH: /usr/local/cuda-12.3/lib64
- Spack 建议如果系统中有这些包就写进去：
opensslgit。这些包确实很多系统都有附带，直接使用可以节省一些编译时间。当然很多时候我们用 Spack 就是不想自己解决依赖，希望一行命令解决所有事情，全都让 Spack 自己装一套也行。
基础¶
- 安装：
spack install@指定版本^依赖项%指定编译器+启用选项，++在依赖之间传递选项-关闭选项，--在依赖之间传递选项。~与-同义。它们两个的存在只是为了在某些情况下阻止 shell 展开、又能阻断标识符名称这些作用。
~and-are the same.~is there to disambiguate from-because-is also a valid identifier.-is also allowed because~can be expanded by shells if you add a space before it...
name==<value>指定非布尔形变量的值（上面两个都用于布尔形变量）target=, os=指定架构flag=指定编译选项，可以用的有：cflags,cxxflags,fflags,cppflags,ldflags, andldlibs
建议：安装前检查依赖关系是否正确：
- 位置：
spack location--install-dir
- 配置：
spack configedit
- 已安装的包：
spack find- 详细信息：
-dfv包含依赖、编译选项、变量，都是常用的信息。
- 详细信息：
- 查询：
spack info、spack list - 差异：
spack diff，安装了不同选项、版本的程序时，可以用它来比较差异。
结合 pkg-config 处理库依赖¶
执行 spack load 后我们会发现环境变量中多出了很多 PKG_CONFIG_PATH 。 pkg-config 通过它执行第三方库头文件和库文件的编译、链接。这样我们就不用手写 -I 等指令了。下面是一个例子。
Spack 已经帮我们弄好了这些包的配置。如果需要自己为某个包写配置，需要学习编写 .pc 文件。
进阶概念¶
- Virtual Packages: 虚包
比如 OpenMPI、IntelMPI、MPICH，它们是 MPI 的不同实现。因此它们都提供一个虚包 mpi，其他程序只会依赖于 mpi 这个包，而不会依赖于某个具体实现。
使用 spack info --all 可以查看提供的虚包，这里以 ATLAS 为例，可以看到：
也就是说， atlas 会自动取代 blas/lapack 等的位置，提供它们的服务。
错误处理¶
过于老旧的包¶
ATLAS 无法识别 CPU
构建过程的很多错误往往是因为代码太老、不符合新的语法规范、功能弃用。如果有可能，不要再使用该包，选择新的可替代的包，不然可能需要花很大精力调整编译选项。比如 ATLAS，其稳定的包已经是 2016 年的了，编译时爆出了很多弃用的函数、不能识别目前的 CPU 等等问题，因此还是放弃该包比较好。
对于 BLAS，其实官网提供了 Vendor-Specific 的列表，可以找到：intel-oneapi-mkl 就是 Intel 平台上的优化实现，改用它即可。
解决编译、链接问题¶
这些问题常常是由于编写安装脚本的人没有考虑完善导致的，没有指定链接某些库，导致编译过程中断。如果对 ld 等链接工具熟悉，就能够自行添加相应的选项完成编译。下面记录几个例子：
使用 intel-oneapi-mpi 依赖安装 hwloc ，提示缺少 MPI 相关符号，很显然是没链接 MPI 库。
- 首先检查 786 行的编译命令，其实这里并没有指定链接 MPI 库，因此应当添加
-lmpi选项。更改为：
- 这个问题折腾了我一个多小时，才慢慢找到上面这个问题。一开始我反射性地认为可能是路径缺失，因此尝试以各种方式为
ld添加搜索路径，但最后发现它根本没指定链接。 - 如果是路径问题，
ld的报错应该是找不到某个库，而不是未定义符号，比如：